Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EHD4Q9H223 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EHD4Q9H223 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms