Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms