Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM3Q9BZL3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms