Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX4Q9BYU1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX4Q9BYU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms