Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIFKQ9BYG3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms