Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIOK2Q9BVS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms