Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3CQ9BUI4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3CQ9BUI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3CQ9BUI4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms