Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPOQ9BU64 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPOQ9BU64 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms