Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AGMATQ9BSE5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGMATQ9BSE5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms