Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms