Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TREX2Q9BQ50 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms