Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms