Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CICQ96RK0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms