Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD11Q96NU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms