Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms