Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2E2Q96LR5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms