Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms