Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms