Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms