Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms