Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPNQ96H22 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms