Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APIPQ96GX9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms