Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHFRQ96EP1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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