Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM44Q96DX7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM44Q96DX7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms