Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF34Q969K3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms