Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL5Q93034 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL5Q93034 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms