Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms