Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIFAP3Q92845 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms