Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRUQ92729 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms