Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3AQ92664 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms