Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms