Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOPBP1Q92547 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOPBP1Q92547 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms