Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113Q902F9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms