Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD13Q8WZ19 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD13Q8WZ19 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD13Q8WZ19 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD13Q8WZ19 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD13Q8WZ19 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD13Q8WZ19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD13Q8WZ19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms