Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CSRNP3Q8WYN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CSRNP3Q8WYN3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.4 ms