Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms