Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDM1Q8NG50 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDM1Q8NG50 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms