Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELBQ8NG08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms