Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms