Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGBL3Q8NEM8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGBL3Q8NEM8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms