Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN4CLQ8ND94 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN4CLQ8ND94 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms