Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms