Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms