Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms