Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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DTX3Q8N9I9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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DTX3Q8N9I9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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DTX3Q8N9I9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DTX3Q8N9I9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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DTX3Q8N9I9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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DTX3Q8N9I9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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DTX3Q8N9I9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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