Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCL2Q8N4E4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms