Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms