Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR49Q8IV35 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms