Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms