Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms